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Umbu-cajá (Spondias sp.) es una especie de fruto nativa de la región semiárida brasileña con alto potencial de cultivo. La pulpa jugosa se utiliza en la producción de jugos y néctares. El objetivo de este estudio fue caracterizar a 18 individuos de umbu-cajá en tres sitios ubicados en los municipios noreste de Mossoró / RN y Apodi / RN para identificar individuos con atributos superiores para procesamiento de frutas y / o consumo in natura. Se realizó la caracterización morfológica, física y fisicoquímica de 20 frutos de cada individuo. Las hojas de los árboles se utilizaron para los análisis moleculares mediante Secuencias Intergénicas Repetidas Simples (ISSR) y la Amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD). Se pudo verificar la existencia de variabilidad fenotípica entre los frutos de los árboles umbu-cajá. Los individuos de la misma región se agruparon en el mismo grupo. Los individuos JZ5, JZ6 y MA6 pueden usarse para el procesamiento de pulpa, mientras que JZ1, JZ2, JZ3 y JZ6 son adecuados para el consumo in natura. Los análisis moleculares mostraron polimorfismo para los dos marcadores moleculares utilizados. El ISSR generó el mayor polimorfismo entre los individuos. Sin embargo, el marcador RAPD permitió lograr un grupo más consistente, lo que está de acuerdo con la distribución geográfica de estos individuos. El uso de marcadores morfológicos junto con marcadores moleculares constituye una herramienta importante para caracterizar individuos umbu-cajá.

Palabras clave: ISSR, RAPD, recursos genéticos, Spondias sp.