Predicción de la afinidad de ligandos antagonistas por receptores de adenosina A2A usando árboles de decisión
Dublin Core | Elementos de metadatos PKP | Metadatos para el documento | |
1. | Título | Título del documento | Predicción de la afinidad de ligandos antagonistas por receptores de adenosina A2A usando árboles de decisión |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Adonis Huici Corrales; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Aliuska Morales Helguera; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Evys Ancede Gallardo Ancede Gallardo; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba. Centro de Nanociencias Aplicadas (CENAP), Universidad Andrés Bello. Ave República 275. Santiago. Chile.; Cuba |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Reinaldo Molina Ruiz; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Marta Teijeira Bautista; Departamento de Química Orgánica, Facultad de Farmacia, Universidad de Santiago de Compostela. Santiago de Compostela. La Coruña. España.; España |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Guillermo Abreu Stincer; Departamento de Química, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba |
2. | Creador/a | Nombre de autor/a, institución, país | Eugenio Martínez Albelo; Departamento de Química, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba |
3. | Materia | Disciplina(s) | Agricultura; Biotecnología |
3. | Materia | Palabra/s clave | aprendizaje automatizado; clasificación; modelación; QSAR |
4. | Descripción | Resumen | Las enfermedades neurodegenerativas están siendo tratadas mediante la modulación de los receptores de adenosina con antagonistas más eficaces, seguros y selectivos. El objetivo del estudio consistió en desarrollar una metodología para obtener modelos de clasificación sobre la base de algoritmos de árboles de decisión y descriptores de 0D a 2D de familias no congenéricas de compuestos orgánicos para predecir cualitativamente la afinidad ligando-RAA2A. Para ello se construyó y curó una base de datos no congenérica de 315 antagonistas con su constante de inhibición en nano molar, etiquetados como potentes y débiles. Se utilizaron los programas Dragon e ISIDA/QSPR para calcular descriptores moleculares y se obtuvieron cinco grupos de descriptores. En cada grupo se seleccionaron 50 descriptores usando el criterio mRMR. La base de datos se dividió en series de Entrenamiento, Prueba y Externa mediante una selección aleatoria y un análisis de clúster k-means generalizado. Se desarrollaron y validaron clasificadores utilizando el programa WEKA. Los resultados fueron analizados mediante las pruebas estadísticas de Friedman y Wilcoxon. Se comprobó la influencia significativa del parámetro m del algoritmo J48 en la predictividad, para los modelos que usaron los descriptores de los grupos aug.a-b e hyb.aug.a del ISIDA/QSPR. El modelo de mejor desempeño se obtuvo de los descriptores seleccionados del grupo ISIDA-todos con un valor de m=6 y alcanzó 90.6% de predicción sobre la serie Externa. La metodología desarrollada para obtener modelos de clasificación sobre la base de algoritmos de árboles de decisión y descriptores de 0D a 2D de familias no congenéricas de compuestos orgánicos es efectiva para predecir cualitativamente la afinidad ligando-RAA2A con una exactitud, especificidad y selectividad superiores al 90%.
Palabras clave: aprendizaje automatizado; clasificación; modelación; QSAR |
5. | Editorial | Institución organizadora, ubicación | Instituto de Biotecnología de las Plantas |
6. | Colaborador/a | Patrocinador(es) | |
7. | Fecha | (DD-MM-AAAA) | 2019-06-01 |
8. | Tipo | Estado y género | Artículo revisado por pares |
8. | Tipo | Tipo | |
9. | Formato | Formato de archivo | Suppl, HTML, PDF |
10. | Identificador | Identificador uniforme de recursos | https://revista.ibp.co.cu/index.php/BV/article/view/623 |
11. | Fuente | Título; vol., núm. (año) | Biotecnología Vegetal; Vol. 19, Núm. 2 (2019) |
12. | Idioma | Español=es | en |
13. | Relación | Archivos complementarios | |
14. | Cobertura | Localización geoespacial, periodo cronológico, muestra de investigación (sexo, edad, etc.) | |
15. | Derechos | Derechos de autor/a y permisos |
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