Metadatos de indexación

Predicción de la afinidad de ligandos antagonistas por receptores de adenosina A2A usando árboles de decisión


 
Dublin Core Elementos de metadatos PKP Metadatos para el documento
 
1. Título Título del documento Predicción de la afinidad de ligandos antagonistas por receptores de adenosina A2A usando árboles de decisión
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Adonis Huici Corrales; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Aliuska Morales Helguera; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Evys Ancede Gallardo Ancede Gallardo; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba. Centro de Nanociencias Aplicadas (CENAP), Universidad Andrés Bello. Ave República 275. Santiago. Chile.; Cuba
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Reinaldo Molina Ruiz; Centro de Bioactivos Químicos, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Marta Teijeira Bautista; Departamento de Química Orgánica, Facultad de Farmacia, Universidad de Santiago de Compostela. Santiago de Compostela. La Coruña. España.; España
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Guillermo Abreu Stincer; Departamento de Química, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba
 
2. Creador/a Nombre de autor/a, institución, país Eugenio Martínez Albelo; Departamento de Química, Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Santa Clara. Villa Clara. Cuba.; Cuba
 
3. Materia Disciplina(s) Agricultura; Biotecnología
 
3. Materia Palabra/s clave aprendizaje automatizado; clasificación; modelación; QSAR
 
4. Descripción Resumen

Las enfermedades neurodegenerativas están siendo tratadas mediante la modulación de los receptores de adenosina con antagonistas más eficaces, seguros y selectivos. El objetivo del estudio consistió en desarrollar una metodología para obtener modelos de clasificación sobre la base de algoritmos de árboles de decisión y descriptores de 0D a 2D de familias no congenéricas de compuestos orgánicos para predecir cualitativamente la afinidad ligando-RAA2A. Para ello se construyó y curó una base de datos no congenérica de 315 antagonistas con su constante de inhibición en nano molar, etiquetados como potentes y débiles. Se utilizaron los programas Dragon e ISIDA/QSPR para calcular descriptores moleculares y se obtuvieron cinco grupos de descriptores. En cada grupo se seleccionaron 50 descriptores usando el criterio mRMR. La base de datos se dividió en series de Entrenamiento, Prueba y Externa mediante una selección aleatoria y un análisis de clúster k-means generalizado. Se desarrollaron y validaron clasificadores utilizando el programa WEKA. Los resultados fueron analizados mediante las pruebas estadísticas de Friedman y Wilcoxon. Se comprobó la influencia significativa del parámetro m del algoritmo J48 en la predictividad, para los modelos que usaron los descriptores de los grupos aug.a-b e hyb.aug.a del ISIDA/QSPR. El modelo de mejor desempeño se obtuvo de los descriptores seleccionados del grupo ISIDA-todos con un valor de m=6 y alcanzó 90.6% de predicción sobre la serie Externa. La metodología desarrollada para obtener modelos de clasificación sobre la base de algoritmos de árboles de decisión y descriptores de 0D a 2D de familias no congenéricas de compuestos orgánicos es efectiva para predecir cualitativamente la afinidad ligando-RAA2A con una exactitud, especificidad y selectividad superiores al 90%.

 

Palabras clave: aprendizaje automatizado; clasificación; modelación; QSAR

 
5. Editorial Institución organizadora, ubicación Instituto de Biotecnología de las Plantas
 
6. Colaborador/a Patrocinador(es)
 
7. Fecha (DD-MM-AAAA) 2019-06-01
 
8. Tipo Estado y género Artículo revisado por pares
 
8. Tipo Tipo
 
9. Formato Formato de archivo Suppl, HTML, PDF
 
10. Identificador Identificador uniforme de recursos https://revista.ibp.co.cu/index.php/BV/article/view/623
 
11. Fuente Título; vol., núm. (año) Biotecnología Vegetal; Vol. 19, Núm. 2 (2019)
 
12. Idioma Español=es en
 
13. Relación Archivos complementarios
 
14. Cobertura Localización geoespacial, periodo cronológico, muestra de investigación (sexo, edad, etc.)
 
15. Derechos Derechos de autor/a y permisos Copyright (c) 2019 Biotecnología Vegetal
Licencia de Creative Commons
Este obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial 4.0 Internacional.