A partir del ADN genómico extraído de cinco somaclones de caña de azúcar resistentes a la roya y su donante susceptible, Saccharum officinarum var B 43-62, se realizaron AFLPs (amplified fragment length polymorphism) utilizando tres combinaciones de cebadores (EcoRI/aca : MseI/acc ; EcoRI/aca : MseI/atg y EcoRI/aca : MseI/agg). Fueron obtenidas seis bandas polimórficas, de las cuales dos aparecieron solamente en los genotipos resistentes, las que probablemente estén relacionadas con el carácter de resistencia a la roya. Éstos fragmentos fueron clonados, con el objetivo de determinar su secuencia nucleotídica y estudiar el papel que desempeñan dentro del mecanismo de resistencia que desarrollan estos somaclones frente a la infección por Puccinia melanocephala.

Palabras clave: marcadores moleculares, Puccinia melanocephala, Saccharum