Biotecnología vegetal fue fundada como publicación impresa en el año 2000 con ISSN 1609-1841, RNPS: 0397 con el objetivo de difundir los avances en el campo de la biotecnología aplicada a plantas en Cuba y Latinoamérica. Es una revista que publica resultados de investigaciones básicas y aplicadas.
En el año 2009 se incorporó la versión digital ISSN 2074-8647, RNPS: 2154 y se pusieron a disposición de la comunidad científica todos los números publicados con acceso abierto a los contenidos en formato pdf y htlm.
En el año 2012 Biotecnología vegetal fue certificada por el CITMA.
A partir de octubre de 2016 comenzó su gestión editorial en Open Journal System.