Diversidad genética en cultivares de Manihot esculenta Crantz en Nicaragua determinada mediante microsatélites (SSR)

Erwin Aragon, Víctor Aguilar, Jecsa Arguello

Resumen


Un total de 37 cultivares de yuca, colectados en cuatro departamentos de Nicaragua, fueron investigados mediante microsatélites, para revelar la diversidad genética y evaluar las relaciones filogenéticas con cultivares mejorados, con perspectiva a garantizar un manejo sostenible de los recursos genéticos que dispone el país. Los análisis de diversidad y diferenciación genética fueron desarrollados a partir de los datos obtenidos de nueve marcadores microsatelitales (SSR). Se detectó un total de 47 alelos y el número de alelos por locus varió de tres a nueve. Se encontró un alto índice de diversidad genética con 0.61. El valor promedio del Coeficiente de Información Polimórfica fue de 0.60. Esto demostró que los marcadores más informativos y polimórficos fueron GA-131, SSRY 100 y GA-12. El análisis molecular de varianza mostró una mayor diferencia dentro del grupo, no así entre grupos. La mayor distancia genética, se encontró entre el grupo de Matagalpa con el de Río San Juan, con menor distancia la Región Autónoma del Atlántico Sur con las Internacionales, mientras que el grupo de Río San Juan y León, presentaron la mayor identidad genética. El Análisis de Componentes Principales permitió identificar duplicidad dentro de las accesiones colectadas.

 

Palabras clave: accesiones, alelos, locus, yuca.


Texto completo:

PDF HTML

Referencias


Beovides, Y, Fregene M, Alves A, Gutierrez , Buitrago C, Marin J, Milian M, Rodríguez S, Cruz J, Ruiz E, Guerra D, Toledo H, Roca O, Albert J, Garcia J, Oliva M (2006) Análisis de diversidad genética mediante microsatélites (SSR) en cultivares de germoplasma cubano de yuca. Biotecnología Vegetal 6: 9-14

Casalla, R (2003) Medición de la distancia genética en grupos de camarón blanco Liptopenaeus vannamei en la costa ecuatoriana. Tesis. MSc. Escuela superior politécnica del litoral, facultad de ingeniería marítima y ciencias del mar. Guayaquil. EC. 83 p.

Chavarriaga, AP, MM Maya, MW Bonierbale, S Kresivich, MA Fregene, J Tohme, G Kochert (1998)

Microsatellites in cassava (Manihot esculenta Crantz): Discovery, inheritance and variability. Theor Appl Genet 97: 493-501

Dixon, A (2002) Simple sequence repeat SSR marker diversity in cassava Manihot esculenta Crantz landraces form Nigeria. Annual Report: Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT. Cali. Annual Report: Output 8-43

Doyle, JF, Doyle, JL (1990) Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12: 13_15

Excoffier, L, G Laval, S Schneider (2005) Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics Online 1:47-50

INIDE, MAGFOR (2012) IV Censo Nacional Agropecuario. 64 páginas. [En Línea] Disponible en: http://www.inide.gob.ni/ Consultado: 10 de mayo 2012

Morrillo A (2009) Mapeo de regiones del genoma asociadas con el contenido de â-caroteno en yuca (Manihot esculenta Crantz).Tesis. Dr. Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias Agrarias. Palmira, CO. 254 p.

Nei, M (1972) Analysis of gene diversity in subdivided groups. USA. Proceedings of the National Academy of Sciences 70: 3321_3323

Peakall, R, PE Smouse (2006) GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes 6: 288-295

Siqueira, M, R Jurema, E Queiroz, B Borges, J Kayo, J Pereira (2009) Genetic characterization of cassava (Manihot esculenta) landraces in Brazil assessed with simple sequence repeats. Genetics and Molecular Biology 32: 104_110

Weir, B, C Cockerham (1984) Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution 38:1358-1370

Wilches, A (2004) Descripción de las herramientas moleculares y sus aplicaciones en la agricultura. Guatemala. Instituto de agricultura, recursos naturales y ambiente de la URL. Serie No. 15. 25

p. [En Línea]. Disponible en: http://www.elpueblopresidente.com/AGROFORESTAL/6069.html Consultado 08 marzo 2011

Yeh, FC, TJB Boyle (1997) POPGENE V.3.2. Population genetic analysis of codominant and dominant markers and quantitative traits. Belgian Journal of Botany 129: 157

Zaldívar, M, O Rocha (2006) Diversidad genética y variación en la viabilidad de plantas cultivadas en sistemas agrícolas. Proyecto de investigación de la escuela de biología. CR. p. 23




Copyright (c) 2016 Biotecnología Vegetal

Biotecnología Vegetal eISSN 2074-8647, RNPS: 2154. ISSN 1609-1841, RNPS: 0397 Editada por: Instituto de Biotecnología de las Plantas. Universidad Central Marta Abreu de Las Villas. Carretera a Camajuaní km 5.5, Santa Clara, Villa Clara, Cuba CP 54 830 Tel: 53 42200124, e-mail: info@ibp.co.cu

Licencia Creative Commons
Biotecnología Vegetal
está bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0 Internacional.